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Principle of Biochemistry

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最後兩個 lectures 講 glyoxylate cycle。

在植物和細菌堙A它們可以通過 glyoxylate cycle 去 bypass oxidative decarboxylation,結果是那些本來會被 decarboxylate 走的碳原子可以用來做其它 biosynthesis,比如說gluconeogenesis。

進入 glyoxylate cycle 的入口主要是 isocitrate lyase和對 isocitrate dehydrogenase 的 inhibition。針對isocitrate lyase,免疫系統會分泌itaconic acid去 competitively inhibit isocitrate lyase。

Introduction to Biochemistry - Quiz 3.4.5



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Lecture 3.5 講的是 electron transport chain。

Citric acid cycle 做了很多NADH 和 FADH2,這些universal electron acceptor 會在 electron transport chain 中貢獻出電子,通過一系列的 redox reaction, NADH 會把它的電子傳給 Coenzyme Q - Cytochrome 和最終到 oxygen 。

在傳送的過程,electron transport chain 會在 mitochondria matrix 和 mitochondria intermembrane space 中間做成一個 proton gradient,這個 proton gradient 是 ATP synthesis 的關鍵!
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.5.1
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.5.2
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.5.3






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十一月忙到飛起 …… 到左感恩節,終於有時間再 post

Lecture 3.6 研究 ATP Synthase 呢個 molecular machine 。

人體自然 nano-tech 超高效能機器,能將 electron transport chain 的 reduction potential 和 charge gradient 變成動能 (rotation of the stalk) 再變成化學能 (ATP) |效率高達 90% ,人類做的機器望塵莫及…

Introduction to Biochemistry - Quiz 3.6.1
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.6.2
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.6.3






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其實題目我早就做好了,只是還沒有完成寫博客。
這次是一個綜合測驗 citric acid cycle + electron transport chain + ATP synthase。

隔一段時間再寫博客也有這樣做的好處,好像我忘記了glyoxylate -> malate 需要 acetyl-CoA,現在一寫又提醒了,也好。

Introduction to Biochemistry - End of session 3.4, 3.5, 3.6 assessment






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今日我完成左 Unit 3.7 既博客

Introduction to Biochemistry - Quiz 3.7.1
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.7.2
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.7.3
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.7.4

這一章既重點係 regulation。在生物堙Areaction 不能一直進行,比如說 glycolysis,它的速度必須和能量的需要匹配。
生物有各種方法對 reaction 的速度作出調節。

這章先由 allosteric regulation 開始講,然後講 glycolysis 中的各個 regulation point,如 hexokinase,PFK-1,Pyruvate Kinase 等等是如何被 activate/inhibit 的。

[ 本帖最後由 darigold 於 2017-12-31 02:45 PM 編輯 ]



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darigold兄, 我剛粗略看了閣下一直以來的學習blog. 小弟對於閣下的學識和對知識的熱情極度佩服!





不斷的向前走。走累了,停下來望望四周。突然發覺原來的地方才是目的地...

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今日我完成左 Unit 3.8 一半既博客

Introduction to Biochemistry - Quiz 3.8.1
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.8.2
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.8.3
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.8.4

這一章講血糖的調節,介紹了在低血糖時需要進行的 gluconeogenesis 和 glycogenolysis,和在高血糖下要做的 glycogenesis ,和這些 reactions 的調節機制。我記得為了這幾課我特別畫了個圖總結這些關於血糖的 regulation 總圖。這一章的最後部份是講糖尿病,其實已經有點算是病理學而不是 biochemistry 了。






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呼…終於完成整個 Unit 3
Unit 3.8 的最後一半主講糖尿病,都不像 Biochemistry 了。

Introduction to Biochemistry - Quiz 3.8.5.1
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.8.5.2
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.8.5.3
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.8.5.4
Introduction to Biochemistry - Quiz 3.8.6
Introduction to Biochemistry - End of session 3.7, 3.8 assessment






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